抵达清籁丸沉船船尾区域主要有三种途径选择。第一种是从清籁岛上方的裂口直接进入，这是最直接的路线，但需要提前解开清籁岛相关区域。第二种是通过完成船头部分的解谜后，从船头和船尾连接的通道进入，这种方法适合已经寻觅过船头的玩家。第三种是从清籁岛海岸附近寻找被雷属性碎石堆覆盖的洞口，运用元素反应击碎后即可进入船尾区域。无论选择哪种方法，提议在解谜前先清理洞窟上部的愚人众和船尾附近的海乱鬼，以减少后续寻觅的干扰。

船尾区域的核心解谜需要收集三块继电石。第一块继电石的获取需利用船上的雷传送门，将其路线调整至左下方，传送后会抵达一处雷属性碎石堆附近，运用元素反应击碎后可获取继电石和雷种子。第二块继电石需要返回第一块继电石的位置获取雷种子，给上攀爬至雷种子结界内取得。第三块继电石则需再次获取雷种子，通过转动船尾上方的雷传送门快速传送到含有继电石的结界中。需注意操作时效，避免雷种子消失导致坠落。

完成继电石收集后，需按照特定方法摆放以激活机关。将三块继电石正确连接后，船尾下方的闸门会开始，可进入内部山洞。洞内有三个遗迹机兵，击败后可获取瑰丽宝箱和一只雷灵。跟随雷灵移动，它会激活船尾的雷印枝条，利用雷种子可通过雷极飞至高空中获取雷神瞳。这一经过提议运用身高较高的人物，以进步飞行成功率。

船尾区域的寻觅需注意相位之门的调整。在进入山洞前，提议先将船上的相位之门对准洞穴入口路线，便于后续快速传送返回。船尾解谜经过中也许涉及多次往返，合理利用相位之门能显著提高效率。完成全部解谜后，可通过雷极飞至沉船外部，同时解开相关成就。整个船尾区域的寻觅包含多个宝箱和隐藏收集要素，提议仔细搜寻每个角落。